CDX-2是一种由311个氨基酸组成的蛋白质，是一种肠特异的转录因子，与肠上皮分化有关，在肠道发育的早期表达，调节十二指肠到直肠的肠上皮细胞的增值和分化，定位于肠上皮绒毛和隐窝表面。高表达于十二指肠、结肠及直肠，特异性强。结直肠癌常表现为弥漫核阳性，低分化的结直肠癌常出现缺失表达。在部分伴有错配修复基因异常的结肠癌中表达明显下降。在74%的胃癌表现为CDX2阳性。正常食管上皮阴性，Barrett食管时强阳性。卵巢粘液性肿瘤，尤其是肠型粘液性肿瘤中CDX2也可为阳性。CDX2对于神经内分泌癌的特异性不高，胃肠道和胃肠道外的神经内分泌癌均显示大约40%的阳性率。由于膀胱腺癌来自肠脐尿管，因此CDX2的阳性率非常高。卵巢内膜样腺癌中很少表达，少数前列腺癌也表达CDX2。CDX2染色强度和范围也是非常重要的。CDX2在肠癌中染色几乎所有的细胞都是强阳性，在肝脏腺癌中部分细胞阳性，而且是有强有弱。